本身差别不大，只是各自背景有差异。银河麒麟是有军方背景的，麒麟系统就纯粹民营企业背景。都是基于 Linux 演变而来。
银河麒麟操作系统（ Kylin Operating System ）是天津麒麟信息技术有限公司旗下的国产 Linux 操作系统，源自国防科大"麒麟"、"银河麒麟"操作系统，支持主流 X86 架构 CPU 以及国产飞腾 CPU 平台。
湖南麒麟信息工程技术有限公司（简称湖南麒麟）是 2007 年成立的一家民营企业，公司成立之初依托国防科技大学计算机学院，长期致力于信息安全的研发，在集中管控和机要密码等领域有一定的影响力。
