区别很多:缴费方面，缴费比例规定不一样，每年缴费基数上下限不一样，待遇方面，养老金计发的方式不一样，医保，失业保险，工伤，生育保险的待遇标准不一样。不过，现在社保决新规改变了，养老，医疗，失业保险都可以全国办理转移接续。上海和深圳当然也可以。上海的社保费比深圳高一些。