当然会被记入档案。档案是一个人一生重要信息的载体，求学阶段学籍变动和异动都是特别重要的档案信息，必须如实记入档案。研究生退学属于研究生学籍的异动情况之一，学校会正式发文公布研究生的退学文件，相关文件以及其他支撑材料都会一起保存在档案里，例如研究生申请退学的申请书等。