档案在人社局不会影响考研的。考研报名主要是看学历和专业，与档案存放在哪里没有关系。考研在人社局存放说明不是应届毕业生了，本科毕业后为了考研或者工作将人事档案存放在人社局，但是报考硕士研究生是不会对人事档案存放在哪里有规定的。