医院可以查询建档立卡户。

医院涉及到医保报销，而建档立卡户的报销比例相对比较高，为了方便建档立卡户的报销，扶贫部门的建档立卡系统和医保系统进行了部分关联，所以在医院的报销系统里只要输入建档立卡户的身份证信息就可以查询。