安徽农保在上海各医院住院是可以报销的，但是你在去上海就医之前，要在安徽医保局办理异地就医备案，备案后再去上海金山医院住院，就可以享受出院即报，如果没来得及备案你也可以先在上海医院住院，出院时保存好结算单，复印病历、诊断书并加盖医院章，然后回安徽医保局报销。