用人单位工资扣除社保是合法的，扣除社保不属于乱扣工资。根据《工资支付暂行规定》第十五条 用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：

(一)用人单位代扣代缴的个人所得税

(二)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用

(三)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费

(四)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。