社保是肯定要交的。

“停薪留职”人员在从事其他有收入的劳动时，原则上应按月向原单位缴纳劳动保险基金， 其数额一般不低于本人原标准工资的百分之二十。

如果协议中约定了在停薪留职期间，保险由个人交纳，那这个协议的内容对双方有约束力，单位可以据此停交保险。

如果没有约定，单位继续承担法律规定承担的部分。