公司自主择业补交社保，按公司的欠费年限补交。也就是说，公司拖欠了员工多少年的养老保险，那么就为员工补交多少年的养老保险。

劳动法规定，劳动者和用人单位只要签订的劳动合同，或者形成了事实劳动关系，那么，劳动者就应该获得公司的养老保险，自主择业人员也是公司的员工，那么如果公司要补交社保，就为自主择业人员补交，以前没有缴纳的年限。