三方协议有违约金条款。订立三方协议，除重点讲清三方的权利、义务之外，还要规定三方，特别是用人单位、毕业生的违约责任。如果违约，应怎样处罚，如给付违约金、给多少等，都要在协商签订三方协议之时讲清楚，以便三方互相监督，互相制约，忠实履约。