中国科学院直接参与在上海建的大学只有一所：上海科技大学，由上海市人民政府与中国科学院共同举办、共同建设，由上海市人民政府主管。16年，学校与中国科学院大学联合招收了4届硕博连读研究生。2014年，开始招收本科生。2017年起，学校可独立招收、培养研究生。2018年，学校获批成为博士、硕士学位授予单位。近年，本科生推免比例33%，本科毕业深造率近80%。