詹姆斯二世第一任妻子安妮·海德，生有八个子女，但只有玛丽二世和安妮女王成年，其他均夭折。

第二任妻子玛丽亚·贝亚特丽切·德斯特结，生有十二个子女，其中只有他们的独子詹姆斯·弗朗西斯·爱德华·斯图亚特和公主路易莎·玛丽亚·特蕾莎·斯图亚特成年。

不过，詹姆斯二世还有一名非常有名的私生子詹姆斯·菲茨詹姆斯，西班牙王位继承战争中的法国一方的名将，特威德河畔贝里克公爵元帅。