南通直达济宁火车没有，只有中转的火车。中转火车也有两趟：早上八点半从南通乘坐高铁G2586，十二点到曲阜东，全程五小时十分钟，然后再换乘下午一点二十一分高铁G6965到济宁东。还有一趟下午四点五十四分K62到商丘站再换乘K1138火车到济宁火车站下车。