叶尔羌汗国最兴盛时期的面积是约160多万平方公里。

叶尔羌汗国于公元1514年建立，于1680年为准噶尔部所灭，历时166年。最强盛时期，其疆域包括今新疆大部以及巴尔喀什湖以南、伊塞克湖地区、费尔干盆地至巴达克山及瓦罕走廊一带。

叶尔羌汗国的首都在现在的莎车，鼎盛时期的疆域包括吐鲁番、哈密、塔里木盆地。汗国版图的东方是嘉峪关、南方是西藏、西南是克什米尔、西方与乌兹别克布哈拉汗国为邻，与乌兹别克以费尔干纳谷地为界，北方以天山为界，与东察合台吐鲁番汗国（后被噶尔丹的准噶尔汗国所消灭）相邻。