在柯南剧场版第3部——《世纪末的魔术师》中发现的。

当时，怪盗基德假扮的白鸟一直在跟踪柯南，并观察柯南的行动，于是，柯南在厕所里和博士联系都被他看到了。

剧情的最后，怪盗基德为了还“柯南救他的鸽子”这个人情，变装成“工藤新一”的样子替他解围，柯南也因此逃过了小兰的怀疑。

说明这时候怪盗基德已经明确知道柯南的身份了。