木卫三是太阳系中已知的唯一拥有磁圈的卫星。它拥有一层稀薄的含氧大气层，其中含有原子氧，氧气和臭氧。而木卫三上是否拥有电离层还尚未确定。木卫三内部结构木卫三的平均密度为1.936g/cm³，表明它是由近乎等量的岩石和水构成的，后者主要以冰体形式存在冰体的质量占卫星总质量的46-50%。