呼吸类型：发酵、有氧呼吸、无氧呼吸

根据微生物的碳源、能源、和氢供体不同可将微生物分为光能无机营养型、化能无机营养性、光能有机营养型和化能有机营养型

类型 能源 基本碳源 氢供体

光无 光 CO2 无机物

光有 光 CO2及简单有机物 有机物

化无 无机物 CO2 无机物

化有 有机物 有机物 有机物例：光无：蓝细菌、紫硫细菌、绿硫细菌等

化无：硝化细菌、硫化细菌、铁细菌、氢细菌、硫磺细菌等

光有：红螺菌科的细菌

化有：大多数细菌和全部真核微生物代谢：化能自养：氧化磷酸化