东莞南站是赣深高铁的一个车站，沿线车站有赣州西（既有）、信丰西、龙南东、定南南（定南西）、和平北（和平东）、龙川西、河源北（东源）、河源东、博罗北、惠州北、仲恺、东莞南（塘厦）、光明城（既有）、深圳北（既有）。2017年8月17日，东莞市城市轨道交通第二轮建设规划（调整）及线网规划（调整）环境影响评价第一次公示，东莞地铁1号线新增1条支线到东莞南站连接赣深高铁，新支线以富民南站为起点，途经赣深高铁东莞南站，终点为塘厦南站，线路全长约31公里。