荧光斑马鱼不是染色的。概括来说它们是科学研究的产物，经过科研人员导入荧光蛋白基因，经过多代培育，有部分荧光蛋白基因稳定下来可遗传到后代中。

转基因的荧光基因最开始是红色，后面陆续有了蓝莓，荧光黄，绿翡翠等，转入的基因只能是颜色，而没有天生鱼的鳞片那种光泽。所以斑马鱼有颜色而无光泽，没有鳞片的光泽美感，斑马鱼后代荧光基因稳定，子代基因基本由亲本基因决定，少部分颜色存在变化。