普洱市凤凰山地处云贵高原西南边缘、横断山系纵谷区东南段，即哀牢山脉中段。全山地形北部狭窄、南部较宽，似纺锤状，地势自西北向东南倾斜。境内山高谷深，河流纵横，最高点在境内东北部联珠镇的大尖山，海拔2278米，最低点在境内南部泗南江镇的榄皮河与龙马江汇流处、海拔440米。境内主要河流有把边江、泗南江、阿墨江，他郎河、布意河、坝干河、那卡河、杩木河，简称“三江五河”，均属红河水系。