妖书案是明代万历年间的一桩疑案。万历二十六年（1598年）妖书第一次出现，题为《忧危竑议》万历三十一年（1603年）妖书第二次出现，题为《续忧危竑议》。妖书案其实是发生于万历三十一年(1603年)由国本之争引起的党争。这一案件虽然不了了之﹐却充分暴露出明末朝廷中党争的激烈。 第二次妖书案与伪楚王案、劫杠案共称“楚宗之乱”或“楚宗之争”。

妖书案以皦生光受冤而死结案，一方面暂时结束了人人自危的混乱局面，另一方面也使门户之争愈演愈烈，党争在此后很长时间内成为明代政治的一大顽疾。