因为它是经过巴氏消毒法处理的牛奶需要储存在较低的温度下（一般<4℃），否则还是有变质的可能性。所以保质期比较短。

巴氏奶大多是玻璃瓶、屋顶状纸盒、塑料袋包装，包装上一般标注的是巴氏奶或者鲜牛奶字样，在超市里放在冷藏柜卖，保质期为1～7天。

由于巴氏奶保质期短，再考虑到检测时间环节，到达超市的产品一般已经临近保质期。目前较流行延长货架期概念，采用125-138℃保持2-4秒的杀菌技术，再冷藏，也叫超巴氏，这样牛奶的保质期可以达30天左右