因运动方式的不同可分为4纲：

1)．鞭毛虫纲Mastigophora

用鞭毛运动，有鞭毛l～数条。如眼虫Euglena viridis。

2)．肉足虫纲Sarcodina

用伪足运动，即体表无固定表膜，原生质可向各方突出，作为运动和捕食的细胞器官。如变形虫Amoeba Pr0teus。

3)．孢子虫纲Sporozoa

全部寄生，生活史中产生孢子。如疟原虫Plasm0dium。

4)．纤毛虫纲Ciliata

用纤毛运动，即体表有众多纤毛。如草履虫Paramecium caudatum。