南京最大的基督（新教）教堂是莫愁路堂，该堂是南京市基督教“两会”所在地。其次才是太平南路的基督教（新教）圣保罗堂，较为古旧、精致。南京最古老的教堂是石鼓路天主堂，是天主教南京教区主教座堂。