将两条及两条以上的基因用序列比对分析软件进行比对,分析被比对基因之间的同源性,差异性,常用比对软件有: DNAMAN,DNASTAR,sapegene,一些在线网站也能比对分析,例如NCBI。

可以用于血缘关系的亲子鉴定