40个班

初一14个班（其中1-12班在初中部，多为片区招生的学生，11-12是3+3超常班。另有13、14班是3+2实验班，在高中部西校区上课）。

初二14个班（其中1-12班在初中部，大多为片区招生的学生，2和7班是特长班，10-12是3+3超常班。另有13、14班是3+2实验班，在高中部西校区上课）。

初三12个班（1-10在初中部上课，11、12为3+2实验班，在深圳中学高中部西校区上课）。