下载好 DNAMAN 8 的软件，并打开。
第一栏为主菜单栏，除了帮助菜单外，有十个常用主菜单第二栏为工具栏第三栏为浏览器栏。 打开File-New，将序列粘贴到弹出的窗口中，点击File-save，保存到指定的文件夹。
将所需比对的序列保存好以后，选中Sequence—Aligment—Multiple aligment sequence进行多序列比较。
在弹出的窗口Sequence&Files中加载序列，File、Fold、channel、Database分别表示从文件、文件夹、channel和数据库中获取序列。勾选窗口中的“DNA”，点击“下一步”。
在弹出的窗口Method中，“optimalaligment”最佳比对方式中有四个高大上的选项：Full Alignment（完全比对）、 Prosile Aligment（轮廓比对）、 New Swquence on Profile （轮廓上的新序列）、Fast Alignment（快速比对），本文选择了Fast Alignment，并且勾选了Try both strands(尝试使用双链)。其他项目不需修改，默认就OK，点击“下一步”。
Duang”，结果就出来啦！点击“Option”可以选择要显示的内容。
