天水修建伏羲庙并祭祀伏羲的历史是比较晚的，有些学者将春秋时期秦人所建西畤、鄜畤等附会为伏羲祭祀，但实际上这些祭祀与后来作为人祖的伏羲祭祀是性质截然不同的，准确地说，先秦至汉代的畤祭及五帝祭祀，是祭祀上帝、天帝，是祭神。而作为人文始祖的伏羲祭祀是到唐中期以后才进入官方祭祀之列。