1、科属区别：金枪鱼和青花鱼所属的目与所属的科都是不同的。金枪鱼所属的目叫颌针鱼目，所属的科是竹刀鱼科而青花鱼所属的目叫鲈形目，所属的科是鲭科。

2、体型区别：金枪鱼和青花鱼的体型也是不同的。金枪鱼在成年之后的长度可以达到35厘米左右，不过相对来说超过35厘米的个体还是比较少的。青花鱼的身体长度则在20-40厘米之间。