近年来，吐鲁番的坎儿井呈衰减之势。全疆坎儿井50年代多达1700条，随着不断的干涸，80年代末已降至860余条。吐鲁番地区坎儿井最多时达1273条，目前仅存725条左右。究其原因，首推吐鲁番地区绿洲外围生态系统的严重破坏。据最新卫星遥感监测数据表明，该地区强烈发展荒漠化土地面积已占总面积的46．87%，而非荒漠化面积仅占总面积的8．8%。

水资源日渐短缺，地下水位不断下降，坎儿井水流量也逐年减少。随着吐鲁番地区经济发展，机井得以广泛使用。