波斯猫眼睛的颜色有蓝色、绿色、紫铜色、金色、琥珀色，鸳鸯眼（即两只眼睛颜色不同），波斯猫眼睛的颜色一般由毛色决定。鸳鸯眼的波斯猫毛色一般为白色，绿色、琥珀色和金色一般属于银灰色系。蓝眼睛和鸳鸯眼的白波斯猫有一定几率遗传性耳聋。