申请租房补贴对房东没有影响。你租房申请补贴是自己的事情，你该付房东多少房租还是多少房租，不过申请补贴时房东应该给你证明你有租房，但不可以出示虚假证明，所以你需要房东证明时要同房东商量，不能强制别人，一般房东都会做的。