蛋白虫如果少量的话，对鱼的危害不大，有的鱼比如曼龙还会把它当食物，但是如果数量较多的话，就必须清理了，当虫体粘附于鱼体上时会造成痒痛等不适，轻者造成鱼蹭缸，重者会造成鱼突然撞缸、厌食、绺鳍等，尤其是粘附于鱼腮上时危害更大。