在蜡菊的果实成熟后，一般为9-10月，便可开始采种，采种时尽量选择那些花色相对较深的花头，并且最好选在清晨，用手来采摘收集，以保证种子的完整性同时避免散落。采下的蜡菊种子应当首先放在阴凉处晾干，晾干进行完毕后，可将晾干的种子装入大小合适的纱布袋中，而后放置于低温干燥处贮藏。