通常，一个细胞中有两个中心粒，彼此成直角排列。每个中心粒的横切面上可以看到四周有9束微管，每束由三根微管组成称为三体微管，中央没有微管，这种结构模式称为 9（3）+0 排列。同样的，还有9（2）+29（3）+2等结构模式。

中心粒是埋藏在一团特殊的细胞质，即中心体之中的，中心体又称微管组织中心，因为许多微管都是从这里放身状地伸向细胞质中的。