参考文献里硕士论文用字母D表示。

对于参考文献的格式，国家发布了一个相关的国家标准，一般期刊类杂志用字母J表示。出版的专著用大写的M表示。至于题目中说到的硕士毕业论文和博士毕业论文一般都是用字母D表示。当然还有其他的可以参考相关的国家标准。