1、性质不同：毛冬瓜为猕猴桃科植物毛花猕猴桃的根。青冬瓜属葫芦科冬瓜属一年生蔓生或架生草本植物。

2、生长环境不同：毛冬瓜生于海拔250-1100m的山地草丛及疏灌木林中。青冬瓜生长发育适温为25-30℃。

3、分布地区不同：毛冬瓜分布于浙江、江西、福建、湖南、广东、广西、贵州等地。青冬瓜主要分布于亚洲其他热带、亚热带地区，中国各地地区均有栽培。中国云南南部（西双版纳）有野生者，果远较小。澳大利亚东部及马达加斯加也有分布。