《虫巢》讲述了外星虫子入侵地球，在人类起身反抗的过程当中，通过人类感染而出的第一个虫巢女王受到重创。

虫巢的意识让她在濒死一刻选择一个继任者，而后李默被选中。但是在整个感染过程之中，一切并不顺利，李默被意外惊醒。随后他顺利的逃离了虫巢，不过脑袋当中的母虫因为并没有顺利完成自己的使命而呆在他的脑袋里。

为了活下去，李默开始携带着母虫在被虫族渐渐掌握的世界里生存。