北京自然博物馆一共分三层+地下一层。

馆内分为：古爬行动物、古哺乳动物、无脊椎动物的繁荣、恐龙公园、植物世界、神奇的非洲、动物-人类的朋友、水生生物馆、人之由来、走进人体等展览。

整个游览时间大概两个小时，在走马观花的情况下。如果仔细看完，需要三四个小时。