发音不同，恩（en）嗯（ng），虽然在计算机上打字时是同音字，但是字典上有明确的发音和解释，不能混用。恩：是名词，指恩惠或者姓嗯：也可以发（唔）音，有三个声调，没有明确的意思，通常可以表示应答，疑问等意思。作回答时应该是 嗯

恩 不用来作回答的用语，因为恩在汉语里面是名词，如果你看见这样的用法，那是因为这样用的人写了错别字。