尼尔斯不爱学习，一看到书本就会犯困不爱牧鹅放鸭，会经常捉弄家里饲养的小动物，以至于家禽看到他就会咬他。

可是同住一个小村庄里的还有一群小精灵，尼尔斯有一天戏弄了一只小精灵，受到惩罚变成一个拇指大的小人。还没等他弄明白是怎么回事，他已经骑在家鹅马丁的脖子上，和一群野鹅飞上了天空。