紫萱在仙3结局就死了，徐长卿靠吞紫萱的内丹成仙。在3外是蜀山掌门，蜀山在他手中空前发展，是蜀山的巅峰时期。

他后来知道了紫萱的真相，加上他的壮大蜀山的举动反而破坏了六界的平衡差点让蜀山万劫不复，最后辞去掌门隐居山林，不问世事了。具体的去玩仙剑3外传，讲的就是仙剑3故事的18年后。仙剑3的人物包括重楼都有出场，讲明了每个人的归宿。