父子基因相似度有50%。一个人的血缘关系和遗传基因分别来自父母的各50%。因此孩子既有父亲50%的相似基因，也有母亲50%的相似基因，所以父子基因相似度有50%。父母与子女之间是直系血亲关系，父母是给予子女生命的人，子女也是父母生命的延续。