斗破苍穹云韵不阻止云岚宗灭萧家的原因是：云韵并不知道云山已经投靠了魂殿，所以她并不知道云棱在魂殿婺护法的挑拨下攻击萧家，也就没有机会阻止云棱，直到萧炎第二次杀上了云岚宗，云韵才在萧炎口中知道了云棱背着自己偷袭了萧家，导致了萧家收到重创，族长萧战使用，可以说这是非常无奈的事情。