星汉灿烂中的文帝责罚凌不疑的原因是：凌不疑当众杖责五皇子，让也没颜面尽失，不得已选择杖责凌不疑，可以说在得知了五公主把程少商推下了湖中并且放水蛇咬之后，他就冲冠一怒为红颜教训正在调戏程少商的五公主，这也让凌不疑受到了惩罚。