月升沧海中的阿飞两兄弟结局获得了善终，并且阿飞两兄弟回到了京城娶妻生子，这是一个非常圆满的结局，阿飞两兄弟是主角凌不疑最信任的人，所以在经历了五年的磨难后，他们和凌不疑一起回到了京城，获得了文帝的重赏，这也让他们获得了一个圆满的结局。