三权分立跟三省六部没有一毛钱关系，三权分立是司法行政和监察各自独立互不隶属，基于国家宪法的框架下独立运行而又相互制约。

三省六部在隋唐是中书省拟订诏书，门下省审核，尚书省下的六部执行的一个体系，三省六部完全在皇权的控制之下。三权分立只有在民主国家才有可能施行，三省六部完全是专制集权政府行政的缩影。谈不上对皇权有制约。