两个词的区别在于指向不同。，消除的意思是指使不存在，除去不利的事物。如消除隐患，消除隔阂，消除战争威胁等。

铲除的意思是指连根除去，消灭干净。如，铲除杂草，铲除祸根等。比如说，这次大排查，一定要把工作做得仔细扎实，把一切可能发生的隐患消除掉。